近20年來，我國中藥產業獲得了較為快速的發展，年平均增長速度達20%以上，年銷售額已突破800億美元。但是，從總體情況來看，我國中藥產業的發展水平并不理想。中國中醫科學院中藥研究所提供的數據顯示，占全世界人口25.22%的中國，醫藥產業僅占全球的7%，天然藥物僅占世界天然藥物市場的3%-5%，中藥出口額不足國際中草藥市場的10%，與我國天然藥物大國的地位極不相稱。2003年，全國中藥工業總產值（中成藥和飲片）達810.27億元，占醫藥工業總產值的26.11%，僅占GDP的0.69%。另一方面，中醫藥在國際市場上仍處于尷尬地位，身份難以合法化。由于地位尷尬，使得中醫藥雖然在世界100多個國家有市場，但普遍難以進入國際醫藥和保健品的主流市場，大部分只能在華人圈子里使用。

　　2.中藥產業基礎薄弱，研發投入嚴重不足。

　　目前，我國中醫藥的基礎理論研究和應用基礎研究與其他學科相比基礎薄弱，尚不能對有效藥方的作用機制完全解釋清楚，對其有效成份或有效部位也處于探索階段。同時，中藥產業的生產企業的研發費用投入較低，一般不超過其銷售收入的1%左右，而發達國家相應的研發費用比重是2.5%-4%。由于科研經費投入不足，直接導致了對中藥藥理藥效的研究乏力，無法加大開發中藥新品種的力度，從而制約了中藥現代化產業發展。根據美國制藥協會統計，2000年，美國開發成功一個新藥投入8.02億美元。研發成本的投入占總銷售額的15%以上，而我國遠遠低于這一水平，不足5%。另外，美國需要十多年時間才能研發出一種新藥，而我國一些企業或者研究機構花費5、6年時間都認為過于漫長。風險方面，美國要篩選一萬個化合物，成功率是萬分之二，也就是說，一萬個提出申請的化合物只有1至2個被美國美國食品與藥物監督管理局（FDA）批準為藥物。

　　3.中藥知識產權保護力度不夠。

　　由于不保護藥品的多家生產，對企業投資新藥的吸引力不大，從而造成中藥企業專利市場轉化率低，中藥企業申請專利較少的現狀。制藥企業是一個高技術、高風險、高投入、高回報的產業，而這些小企業用于新藥物的開發研究投入微乎其微，技術附加值極高的新制劑的開發也處于落后狀態。因此，為了生存需要，“進行有限的仿制”便成為許多企業選擇的捷徑。目前，我國新藥的審批條件是，只要符合安全、有效的標準就有可能獲得批準，有沒有優勢和特點并不在審批考慮的范圍內，這使每年都會有大量新藥上市，其中仿、改制品種占有很高比例，新藥不“新”。幾十甚至百家企業競相申報仿制藥物或制劑，最終造成大家互相傾軋，爭先降價。